По действующим правилам, при розничной торговле алкоголем продажи необходимо фиксировать в системе ЕГАИС. Эта обязанность продавца никак не связана с применением или неприменением контрольно-кассовой техники.

Источник: Письмо Минфина от 28.03.2018 № 03-14-11/19448

Поэтому, даже если продавец освобожден от обязанности применять ККТ, он все равно обязан фиксировать в ЕГАИС розничные продажи алкогольной продукции. Также обязательно нужно выдавать покупателю документ со штрихкодом, в котором зашифрованы сведения о факте фиксации информации о реализации алкоголя в единой государственной автоматизированной информационной системе.